Κλωνοποίηση είναι η διαδικασία της δημιουργίας ενός ακριβές αντιγράφου του αυθεντικού. Ένας κλώνος με τη βιολογική έννοια, είναι ένας οργανισμός ο οποίος είναι γενετικά ίδιος με έναν άλλο ζωντανό οργανισμό.
Υπάρχουν δύο κύριες μεθόδοι στα εργαστήρια κλωνοποίησης: η κλωνοποίηση ενός οργανισμού και η κλωνοποίηση του γονιδίου.
Κλωνοποίηση ενός οργανισμού είναι η δημιουργία ενός νέου οργανισμού με την ίδια γενετική πληροφορία όπως με αυτόν που ήδη υπάρχει. Αυτό μπορεί να γίνει με μια διαδικασία που ονομάζεται πυρηνική μεταφορά σωματικών κυττάρων (somatic cell nuclear transfer - SCNT), κατά την οποία αφαιρείται ο πυρήνας από ένα ωάριο και αντικαθιστάται από τον πυρήνα του ωαρίου του οργανισμού που επιθυμούμε να κοινοποιήσουμε. Αφού ο πυρήνας περιέχει (σχεδόν) όλη την γενετική πληροφορία μιας μορφής ζωής, το ωάριο-οικοδεσπότης θα αναπτυχθεί σε έναν οργανισμό γενετικά όμοιο με τον οργανισμό-δότη. Αυτός είναι και ο τρόπος που η Ντόλη το πρόβατο, το πρώτο κλωνοποιημένο θηλαστικό, δημιουργήθηκε – από ένα μοναδικό κύτταρο παρμένο από τον μαστό της μητέρας.
Κλωνοποίηση ενός γονιδίου είναι η εξαγωγή ενός γονιδίου από έναν οργανισμό και η εισαγωγή του σε έναν δεύτερο, όπου μπορεί να χρησιμοποιηθεί και να μελετηθεί. Μερικές φορές η κλωνοποίηση ενός γονιδίου μπορεί να αναφέρεται στην γενετική μηχανική σε ένα γονίδιο συσχετισμένο με κάποιο φαινότυπο (φυσικό χαρακτηριστικό), που μπορεί να μεταφερθεί από έναν οργανισμό σε έναν άλλο.